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Chondroitinsulfat (CS) ist eine Klasse von Glykosaminoglykanen, die kovalent an Proteine ​​gebunden sind, um Proteoglykane zu bilden.Chondroitinsulfat ist in der extrazellulären Matrix und Zelloberfläche tierischer Gewebe weit verbreitet.Die Zuckerkette besteht aus der Polymerisation abwechselnder Glucuronsäure und N-Acetylgalactosamin und ist über eine zuckerähnliche Verbindungsregion mit dem Serinrest des Kernproteins verbunden.

Obwohl die Struktur der Hauptkette des Polysaccharids nicht komplex ist, ist sie hinsichtlich des Sulfatierungsgrads, der Sulfatgruppe und der Verteilung der beiden Unterschiede der Isouronsäure in der Kette äußerst heterogen.Die Feinstruktur von Chondroitinsulfat bestimmt seine funktionelle Spezifität und Interaktion mit einer Vielzahl von Proteinmolekülen.